Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.

Garantující pracoviště:	Ústav biochemie a mikrobiologie Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i.
Studijní program/specializace:	Biochemie a bioorganická chemie ( výuka v českém jazyce )
Školitel:	Ing. Jan Dohnálek, Ph.D.

Anotace

Projekt je zaměřen na experimentální popis protonace chemických skupin, která je klíčová v interakcích typu protein-nukleová kyselina. Na modelovém systému nukleas závislých na kovech budou aplikovány experimentální metody strukturní analýzy – rentgenová krystalografie v atomárním rozlišení a neutronová krystalografie a speciální výpočetní postupy. Výsledkem bude zmapování protonace jednotlivých skupin v interakcích v závislosti na nukleové kyselině i na kontextu koordinace kovového klastru modelového katalytického místa S1-P1 nukleáz. Kandidát zvládá alespoň základy metod strukturní analýzy biologických molekul a biochemie.